草鱼的两种新型免疫球蛋白基因IgZ-2和IgM-IgZ
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国家重点基础研究发展计划资助(2009CB118703)


Novel immunoglobulin heavy chain genes,IgZ-2 and IgM-IgZ in grass carp(Ctenopharyngodon idellus)
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    摘要:

    在草鱼中新发现的两种免疫球蛋白重链的cDNA和基因组序列,其中的一种IgZ命名为IgZ-2,以区别于已报道的IgZ,另一种只有两个恒定区,一个恒定区与IgM相似而另一个与IgZ相似,这一特征与已报道的鲤的IgM-IgZ相似,故同样称为IgM-IgZ。分泌型IgZ-2的cDNA序列包含1 889 bp,编码539个氨基酸,其3′编码区包含267 bp,但缺乏5′非编码区及部分可变区序列。分泌型IgM-IgZ的cDNA全长为1 316 bp,编码361个氨基酸,其5′非编码区包含3 bp,3′非编码区包含227 bp。膜结合型IgM-IgZ由两个膜外显子与CH2中的一个剪切位点剪切而成。氨基酸序列比对结果显示IgZ-2和IgM-IgZ的恒定区存在保守的半胱氨酸。系统进化树分析显示,草鱼IgZ-2以较高的支持率与斑马鱼IgZ聚为一枝,再与草鱼IgZ、草鱼IgM-IgZ和鲤IgM-IgZ这一枝聚为一类。用半定量RT-PCR检测IgZ-2和IgM-IgZ在4条草鱼的器官/组织中的表达,发现分泌型IgZ-2、分泌型IgM-IgZ和膜结合型IgM-IgZ在4条鱼中的表达存在个体差异,但主要都在免疫器官中表达。

    Abstract:

    The cDNA and genomic sequences of IgZ-2 and IgM-IgZ were characterized in grass carp Ctenopharyngodon idellus in the present study.The secretory IgZ-2(sIgZ-2)cDNA sequence of grass carp is 1 889 bp,encoding 539 amino acides,and it contains a 267 bp 3′ untranslated region(UTR),but lacking 5′ UTR and partial variable region(V).The secretory IgM-IgZ(sIgM-IgZ)cDNA sequence of grass carp is 1 316 bp,encoding 361 amino acids,and contains a 3 bp 5′ UTR and a 227 bp 3′ UTR.The cDNA sequence of membrane-bound form IgM-IgZ(mIgM-IgZ)possesses two transmembrane exons,which are also spliced to a site within the CH2 exon.Amino acid alignment based on heavy chain constant regions of Igs showed that IgZ-2 and IgM-IgZ contain conserved cysteines.Phylogenetic analysis indicates that the grass carp IgZ-2 was clustered closely with the reported zebrafish IgZ, and then with IgZ in grass carp,which then was clustered well with grass carp IgM-IgZ and chimeric IgM-IgZ in common carp.There was apparent discrepancy in mRNA expression of sIgM-IgZ,mIgM-IgZ and sIgZ-2 in the four fish.In general,IgM-IgZ and IgZ-2 were expressed mainly in lymphoid organs.

    参考文献
    相似文献
    引证文献
引用本文

肖凡书,许巧情,王欣欣,聂品.草鱼的两种新型免疫球蛋白基因IgZ-2和IgM-IgZ[J].水产学报,2010,34(12):1891~1900

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  • 收稿日期:2010-08-12
  • 最后修改日期:2010-10-01
  • 录用日期:2010-10-08
  • 在线发布日期: 2010-12-13
  • 出版日期: 2010-12-15