文章摘要
基于16S rRNA序列探讨我国海鳝科鱼类分子系统进化关系
Molecular Phylogenetic relationship of Muraenidae species in China Sea based on 16S rRNA gene sequences
投稿时间:2020-10-26  修订日期:2021-01-26
DOI:
中文关键词: 海鳝科  线粒体DNA  16S rRNA序列  系统发育
英文关键词: Muraenidae  Mitochondrial DNA  16S rRNA  Pylogeny
基金项目:(31802300);广东省自然科学基金项目(2018A0303130104);广东省科技计划项目(2017A040403060);广东省重点领域研发计划项目(2019B020215001)通信作者梁日深, E-mail: cheetahliang@126.com ,2,3,4 范蔓桦1 谢瑞琳1 陈玉佩1 李清清1,2,3,4 李江涛1,2,3,4
作者单位邮编
陈铭 仲恺农业工程学院动物科技学院 广州
广东省水环境与水产品安全工程技术研究中心 广州
仲恺农业工程学院 健康养殖创新研究院 广州
广州市水产病害与水禽养殖重点实验室 广州 
510225
范蔓桦 仲恺农业工程学院动物科技学院 
谢瑞琳 仲恺农业工程学院动物科技学院 
陈玉佩 仲恺农业工程学院动物科技学院 
李清清 仲恺农业工程学院动物科技学院 广州
广东省水环境与水产品安全工程技术研究中心 广州
仲恺农业工程学院 健康养殖创新研究院 广州
广州市水产病害与水禽养殖重点实验室 广州 
李江涛 仲恺农业工程学院动物科技学院 广州
广东省水环境与水产品安全工程技术研究中心 广州
仲恺农业工程学院 健康养殖创新研究院 广州
广州市水产病害与水禽养殖重点实验室 广州 
黄燕华 仲恺农业工程学院动物科技学院 广州
广东省水环境与水产品安全工程技术研究中心 广州
仲恺农业工程学院 健康养殖创新研究院 广州
广州市水产病害与水禽养殖重点实验室 广州 
林蠡 仲恺农业工程学院动物科技学院 广州
广东省水环境与水产品安全工程技术研究中心 广州
仲恺农业工程学院 健康养殖创新研究院 广州
广州市水产病害与水禽养殖重点实验室 广州 
梁日深 仲恺农业工程学院动物科技学院 广州
广东省水环境与水产品安全工程技术研究中心 广州
仲恺农业工程学院 健康养殖创新研究院 广州
广州市水产病害与水禽养殖重点实验室 广州 
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中文摘要:
      本研究通过PCR扩增获得我国海鳝科(Muraenidae)8个属26种鱼类16S rRNA序列片段,结合GenBank下载的其他海鳝科序列,利用MEGA 7.0软件分析序列碱基组成、保守位点、变异位点和遗传距离,应用最大似然法及贝叶斯法构建分子系统进化树。结果显示:进化树上,海鳝科主要形成两个分支,鳍尾鯙亚科与海鳝亚科分支,鳍尾鯙亚科包括鳍尾鳝属与鞭尾鳝属;海鳝亚科包括裸胸鳝属、裸海鳝属、泽鳝属、蛇鳝属等8个属,与形态分类一致。鳍尾鯙亚科分支中,鳍尾鳝属与鞭尾鳝属形成平行的姐妹分支;海鳝亚科分支中,斑马裸海鳝单独形成一支,位于该分支基部,剩下的海鳝种类聚为一大分支。分支中裸胸鳝属、泽鳝属、蛇鳝属、海鳝属等属均无法形成单系,物种相互聚集在进化树不同位置,揭示这些种属可能是多系起源,与近期的分子水平研究观点相似。针对目前存在分类争议的种属,进化树结果支持斑马裸海鳝为归为裸海鳝属,为单型属物种。虎斑鞭尾鳝归为鞭尾鳝属,与鳍尾鳝属平行进化。拟蛇鳝与弯牙海鳝属分类地位相距较远,可从弯牙海鳝属分离出来归为拟蛇鳝属。豹纹泽鳝与海鳝属关系十分接近,但其形态上还具有多个泽鳝属的基本特征,至于是否归为海鳝属,还需后续更多的分子与形态学研究加以验证。
英文摘要:
      In this study, 16S rRNA sequences of 27 Muraenidae species of 8 genera from China Sea were obtained by PCR amplification. Combining with other Muraenidae sequences obtained from GenBank, the base composition, conserved sites, variable sites and genetic distance of the sequences were analyzed using Mega 7.0 software and the molecular phylogenetic trees were constructed by maximum likelihood and Bayesian inference methods. Results showed that: In the phylogenetic tree, Muraenidae species formed two major groups: subfamily Uropterygiinae and subfamily Muraeninae group. Uropterygiinae group comprised of two genera Uropterygius and Scuticaria, while Muraeninae group comprised of 8 genera including Gymnothorax, Echidna, Enchelycore, Gymnomuraena etc, which was consistent with the current morphological classification result. In Uropterygiinae group, two genera Uropterygius and Scuticaria formed a parallel sister branch. In Muraeninae group, species Gymnomuraena zebra formed a separate branch and located at the base of the group, the remaining species were clustered into another large branch. Within this branch, genera like Gymnothorax, Echidna, Enchelycore and Muraena could not form monophyletic group. Species in these genera were clustered together in different positions of the phylogenetic tree, revealing their polyphyletic evolutionary status, which were consistent with the recent molecular phylogenetic studies. For the species/genera that were in morphological classificational controversy, our phylogenetic results supported the view that G. zebra was classified into genus Gymnomuraena as a monotypic species. Scuticaria tigrina was classified into genus Scuticaria and its phylogenetic status was sister to the genus Uropterygius. Species Pseudechidna brummeri showed distant relationship with genus Strophidon, which might be separated from Strophidon and classified into genus Pseudechidna. Enchelycore pardalis was closely related with genus Muraena at molecular level, but morphologically, certain Enchelycore basic characteristics also existed in the species. Whether it could be classified into genus Muraena, further comprehensive molecular and morphological studies are needed to confirm.
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